Morgon est un cru étendu, le second en surface après Brouilly, ce qui explique la diversité de ses sols.

Les trois terroirs principaux du cru y sont bien organisés. Les sols issus de granites rencontrent ceux du « cortège des pierres bleues », localisés sur le sommet et le versant est de la Côte du Py et sont très progressivement recouverts vers l’est par des formations de piémont et reprises alluviales anciennes.

On y découvre aussi quelques caractéristiques géologiques remarquables : des schistes noirs.

Les sols composés de schistes noirs produisent des vins charnus, denses et puissants.